本作は重厚なストーリーはもちろん、ファイナルファンタジーシリーズの大きな魅力である「魔法」「ジョブシステム」「バトルシステム」を継承。シミュレーションゲームの面白さを最大限に発揮させたシステムになっています。 おなじみのジョブシステムを進化させた「ジョブメイキング」では20種類以上のジョブに400種類以上のアビリティを自由に組み合わせてキャラクターを成長させることが出来ます。また、バトルシーンでは3Dフィールドに時間の概念を取り入れたCTB（チャージタイムバトル）を採用。より戦略的で緊張感あふれるバトルが堪能できます。

個性的な特徴を持つ「ジョブ」と各ジョブがもつ特有の能力「アビリティ」。この2つの組み合わせによって、自分好みのオリジナルキャラクターをつくることが可能です。

チャージタイム（CT）のゲージが100パーセントになったキャラクターから順に行動することができます。CTゲージのたまるスピードははキャラクターの素早さに比例して早くなります。